Doğrudan Viranşehir MYO'da olmasa da Harran Üniversitesi bünyesinde araştırma faaliyetlerini düzenleyen ve denetleyen çeşitli kurullar bulunmaktadır. Bu yapılar, üniversitenin bilimsel çalışmalarını yönetmek, projeleri değerlendirmek ve araştırma etiğini denetlemekle görevlidir.
Başlıca kurullar şunlardır: